الإدارة العامة للموارد البشرية في الجامعة تتولى تطوير وتنفيذ سياسات الموارد البشرية لدعم الأهداف المؤسسية، وتعمل كجهة متكاملة مع جميع الوكالات والعمادات المساندة والإدارات. تركز على استقطاب الكفاءات وتطوير المهارات من خلال برامج تدريبية فعّالة، وتقديم خدمات تشمل التوظيف، والترقية، وتقييم الأداء. تهدف إلى بناء بيئة عمل إيجابية تُعزز ولاء الموظفين وتحفّز الإنتاجية، بما يسهم في تحقيق رؤية الجامعة الاستراتيجية عبر الاستثمار الأمثل في رأس المال البشري .

الإدارة العامة للشؤون الإدارية والمالية تتولى تنفيذ الميزانية المعتمدة لجامعة بيشة، وفق المعايير والقواعد المحاسبية و التعليمات الصادرة عن وزارة المالية، وتعمل الإدارة على إعداد القوائم المالية والموازنات وإدارة الحسابات والتقارير المالية، ويشمل ذلك إعداد الحساب الختامي للجامعة في نهاية كل سنة مالية، ورفعه ضمن ميزانية الدولة، كما تتابع الإدارة جميع المعاملات المالية المتعلقة بصرف المخصصات، تحصيل الإيرادات، وتوثيق العمليات المحاسبية بدقة وشفافية، مما يساهم في تعزيز كفاءة الإنفاق وضمان الالتزام بالأنظمة المالية.

الإدارة العامة للمرافق والخدمات في الجامعة تُعنى بإدارة وصيانة المرافق الجامعية وتقديم الخدمات اللازمة لدعم البيئة التعليمية والبحثية. تعمل كجهة متكاملة مع جميع الوكالات والعمادات المساندة والإدارات لضمان توفر بيئة آمنة ومريحة، وتشمل مهامها الإشراف على الصيانة، النظافة، الأمن، والخدمات اللوجستية، بما يساهم في تعزيز جودة الحياة الجامعية.

​الإدارة العامة للمشاريع والصيانة في الجامعة تُشرف على تخطيط وتنفيذ مشاريع البنية التحتية وصيانة المرافق الجامعية، وتعمل بشكل متكامل مع الوكالات والعمادات المساندة والإدارات لضمان تنفيذ المشاريع وفق أعلى معايير الجودة. تهدف إلى تحقيق الاستدامة وتوفير بيئة تعليمية وبحثية متطورة من خلال متابعة أعمال الصيانة الدورية وتطوير المرافق.​.

​إدارة مراقبة المخزون في الجامعة تُعنى بمتابعة وضبط المخزون من المواد والمعدات لضمان الاستخدام الأمثل للموارد المتاحة. تعمل بشكل متكامل مع جميع الجهات في الجامعة لضمان توافر المواد بشكل مستمر وتفادي الهدر، من خلال تطبيق أنظمة فعّالة للجرد، والتخزين، والتوزيع بما يدعم العمليات الأكاديمية والإدارية.

​إدارة أملاك الجامعة والأوقاف تُعنى بالإشراف على أملاك وأوقاف الجامعة وتنميتها لتحقيق عوائد مستدامة تدعم الأهداف الاستراتيجية. تعمل بشكل متكامل مع جميع الجهات في الجامعة لإدارة الأصول بكفاءة، من خلال التخطيط والاستثمار الأمثل للأوقاف، بما يساهم في تعزيز الموارد المالية ودعم المشاريع الأكاديمية والبحثية.

​إدارة الاستثمار في الجامعة تُعنى بتطوير وتنفيذ استراتيجيات استثمارية تهدف إلى تنمية الموارد المالية وتحقيق الاستدامة المالية. تعمل بشكل متكامل مع جميع الجهات في الجامعة لاستثمار الأصول المتاحة بفعالية، بما يعزز من قدرات الجامعة في تمويل مشاريعها الأكاديمية والبحثية ودعم خططها الاستراتيجية.

أمانة مجلس الجامعة تُعنى بتنظيم وإدارة شؤون مجلس الجامعة وتنسيق جلساته وإعداد محاضر الاجتماعات. تعمل بشكل متكامل مع جميع الجهات في الجامعة لضمان سير الأعمال بكفاءة وتوثيق القرارات ومتابعة تنفيذها، بما يسهم في دعم القرارات الاستراتيجية وتعزيز الحوكمة داخل الجامعة.