الإدارة العامة للشؤون الإدارية والمالية تتولى الميزانية المعتمدة لجامعة بيشة، وفق المعايير والقواعد المحاسبية و التعليمات الصادرة عن وزارة المالية، وتعمل الإدارة على إعداد القوائم المالية والموازنات وإدارة الحسابات والتقارير المالية، ويشمل ذلك إعداد الحساب الختامي للجامعة في نهاية كل سنة مالية، ورفعه ضمن ميزانية الدولة. كما تتابع الإدارة جميع المعاملات المالية المتعلقة بصرف المخصصات، تحصيل الإيرادات، وتوثيق العمليات المحاسبية بدقة وشفافية، مما يساهم في تعزيز كفاءة الإنفاق وضمان الالتزام بالأنظمة المالية