يهتم القسم بالدراسة الدقيقة لمسببات الأمراض مثل: البكتيريا، الفيروسات، الفطريات، بالإضافة إلى الطفيليات. يقوم القسم بتدريس معلومات مفصلة عن الميكروبات ذات الأهمية الطبية مثل طرق العدوى، أعراض المرض، كيفية التشخيص المعملي، وأخيرا نبذة عن العلاج.